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1.磁共振檢查時間相對較長，不適合危急患者：
檢查一個部位至少需要10分鐘，所以不適合危重患者。因為時間就是生命，快速的診斷和治療才是最重要的。
2.噪音大的空間相對較小:
相信做過磁共振檢查的朋友都知道噪音很大，各種聲音，里面空間很小。幽閉癥患者不能做磁共振。
3.金屬內固定的患者應仔細檢查磁共振：
雖然磁共振檢查比CT檢查更嚴格，但并不是每個人都能隨便進入檢查室。進入磁共振檢查室時，需要去除體外的金屬異物，如鑰匙、銀行卡等，需要取下。
因為磁共振室是一個巨大的磁場，如果體內有固定在金屬中的人，一定要通知臨床醫生和做檢查的醫生，醫生可以在評估風險后決定是否可以做磁共振檢查。尤其是有起搏器的患者，更需要謹慎。
因此，無論是MRI還是CT，都應根據病情的需要進行選擇，可以相互補充，但這兩種檢查方法不能相互替代！
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